주성분에서 분산 계산을 할 때 절댓값을 씌워 계산을 한다면, -값으로 들어온 편차들 즉 그래프의 밑, 위 부분이 구별 없이 주성분 분석을 이용한다면 모두 양수 값으로 들어올 것인데, 이를 복원할 때 문제가 생기는 것 아닌가? 음수 값으로 위치해있던 샘플이 양수 값으로 나오는 것 아닌가?

주성분에서 분산 계산을 할 때 불필요한 정보가 버려진 것이기 때문에 다시 복원해서 정보 손실이 일어나도 모델을 학습시키거나 육안으로 데이터를 확인해도 큰 차이는 없을 것이다.